PCR-DGGE技術(shù)在水牛瘤胃產(chǎn)甲烷菌多樣性分析中的應(yīng)用

【摘要】：【目的】分析水牛瘤胃產(chǎn)甲烷菌的多樣性,為更好地了解水牛瘤胃產(chǎn)甲烷菌提供科學(xué)依據(jù)?！痉椒ā坎杉?6頭廣西本地沼澤型水牛瘤胃內(nèi)容物,提取總DNA,利用產(chǎn)甲烷菌的通用引物擴(kuò)增16SrRNA基因序列進(jìn)行DGGE分析,并對DGGE凝膠上7條優(yōu)勢條帶進(jìn)行回收克隆測序。【結(jié)果】共獲得9條序列(5條為古菌序列、4條為非古菌序列),5條古菌序列中有3條與甲烷短桿菌(Methanobrevibacter)的同源性高達(dá)99%、1條與甲烷短桿菌的同源性達(dá)98%、1條與廣古菌門(Euryarchaeota)熱原體目(Thermoplasmatales)的同源性達(dá)98%;而4條非古菌序列分別屬于擬桿菌(Bac-teroidetes)、厚壁菌(Firmicutes)、變形菌門(Proteobacteria),且彼此間同源性較小?！窘Y(jié)論】通過PCR-DGGE技術(shù)可以較好地分析水牛瘤胃產(chǎn)甲烷菌的多樣性。 【作者單位】： 廣西大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;河北省科學(xué)院生物研究所;河南黃淮學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 水牛 瘤胃 產(chǎn)甲烷菌 PCR-DGGE 多樣性分析
【基金】：廣西大學(xué)研究生創(chuàng)新計(jì)劃項(xiàng)目(2007105930905M079)
【分類號】：S823.83;S852.6
【正文快照】： 0引言【研究意義】產(chǎn)甲烷菌(Methanogen)是一類嚴(yán)格厭氧的古菌(Archaea),隸屬廣古菌門(Euryarchaeota)。目前,分離鑒定的產(chǎn)甲烷菌已有200多種,歸屬于3綱5目10科29個(gè)屬。截至2009年,美國國立生物技術(shù)信息中心(NCBI)公布全基因組測序序列的產(chǎn)甲烷古菌已經(jīng)有22株(朱晨光等,2009)

您可以在本站搜索以下學(xué)術(shù)論文文獻(xiàn)來了解更多相關(guān)內(nèi)容

一株河流污泥中產(chǎn)甲烷桿菌的生物學(xué)特性研究    馬金亮;程輝彩;張麗萍;王宏偉;習(xí)彥花;梁柱;

產(chǎn)甲烷古菌    朱晨光;許政暟;宋任濤;

雞糞沼氣池產(chǎn)甲烷菌多樣性    郎會(huì)花;楊洪江;張永剛;

產(chǎn)甲烷菌研究進(jìn)展    單麗偉,馮貴穎,范三紅

共存于厭氧真菌分離培養(yǎng)液中瘤胃甲烷菌的檢測及其多樣性分析    成艷芬;毛勝勇;裴彩霞;劉建新;朱偉云;

晉南牛瘤胃中古菌分子多樣性的研究    裴彩霞;毛勝勇;朱偉云;

應(yīng)用RFLP和DGGE技術(shù)對沼氣池中產(chǎn)甲烷菌多樣性的研究    徐彥勝;阮志勇;劉小飛;胡國全;

沼氣發(fā)酵微生物研究進(jìn)展    虞方伯;羅錫平;管莉菠;張妙仙;單勝道;

乙二酸鹽對有機(jī)污水厭氧發(fā)酵產(chǎn)沼氣的影響    王志;許櫻;陳雄;王金華;李冬生;

α-酮戊二酸鹽對釀醋廢水厭氧發(fā)酵產(chǎn)沼氣的影響    王志;許櫻;陳雄;廖文談;王金華;李冬生;

DGGE技術(shù)在瘤胃微生物多態(tài)性研究中的應(yīng)用    李啟琳;李燕鵬;王士長;

反芻動(dòng)物甲烷排放量營養(yǎng)調(diào)控技術(shù)的研究進(jìn)展    吳健豪;曲永利;王丹;

反芻動(dòng)物瘤胃甲烷氣體生成的調(diào)控    周懌;刁其玉;

厭氧消化中的產(chǎn)甲烷菌研究進(jìn)展    公維佳;李文哲;劉建禹;

深海熱液噴口生物群落研究進(jìn)展    王麗玲;林景星;胡建芳;

油氣藏埋存二氧化碳生物轉(zhuǎn)化甲烷的機(jī)理和應(yīng)用研究進(jìn)展    魏小芳;羅一菁;劉可禹;帥燕華;

分子生物學(xué)技術(shù)的引入對拓展瘤胃微生態(tài)研究的作用    馬惠忠;孫海洲;

水葫蘆和餐廚垃圾半連續(xù)厭氧發(fā)酵產(chǎn)甲烷研究    陳曉曄;邱曄平;朱建良;

DGGE技術(shù)及其在瘤胃微生物多樣性研究中的應(yīng)用    奚曉琦;王加啟;卜登攀;欒廣春;于萍;劉開朗;魏宏陽;周凌云;

藏靈菇微生物分子生態(tài)分析及微囊化發(fā)酵劑的研究    周劍忠

玉米秸皮粘膠纖維漿粕仿生預(yù)處理工藝和蠕動(dòng)發(fā)酵罐研究    侯哲生

水解酸化—兩級厭氧工藝處理甲醇廢水的試驗(yàn)研究    馬文成

鎳及其螯合物對甲烷發(fā)酵的影響及機(jī)理研究    胡慶昊

瘤胃產(chǎn)甲烷菌定量檢測與微生物菌群調(diào)控研究    郭嫣秋

植物油及十八碳不飽和脂肪酸對瘤胃甲烷生成和微生態(tài)的影響    張春梅

黃牛核組蛋白和谷氨酸脫羧酶基因遺傳變異及其對生長性狀的遺傳效應(yīng)分析    李飛

晉南牛和山羊瘤胃產(chǎn)甲烷菌多樣性研究    裴彩霞

托盤和真空包裝冷卻豬肉冷藏過程中菌相變化規(guī)律研究    江蕓

應(yīng)用超高壓技術(shù)延長低溫火腿的貨架期    韓衍青

雙峰駝瘤胃細(xì)菌多樣性及宏基因組文庫構(gòu)建與初步篩選    張玲

同步厭氧氨氧化甲烷化反硝化的工藝特性研究    張文燕

沼氣發(fā)酵過程中產(chǎn)甲烷菌分子多樣性研究及產(chǎn)甲烷菌的分離    汪婷

厭氧微生物空間載體結(jié)構(gòu)及性能研究    公維佳

EGSB顆粒污泥甲烷化動(dòng)力學(xué)及NO_2的影響    白玉華

黑胸散白蟻（Reticulitermes chinensis Snyder）腸道共生古菌多樣性的初步研究    張燕鴻

旅游生態(tài)可持續(xù)發(fā)展初步研究    魏俊翔

復(fù)合式高效厭氧反應(yīng)器處理生活污水的試驗(yàn)研究    李斌

中藥廢水兩相厭氧處理工藝及其微生物學(xué)基礎(chǔ)的研究    郭立峰

不同溫度牛雞混合糞厭氧發(fā)酵性能的研究    許洪偉

油田產(chǎn)出液中產(chǎn)甲烷菌的分離與特性初步研究    游敏;佘躍惠;孔淑瓊;王正良;

污水處理廠活性污泥中甲烷袋狀菌的分離與鑒定    馬金亮;張麗萍;程輝彩;李輝;王宏偉;

中藥渣農(nóng)業(yè)循環(huán)利用模式產(chǎn)業(yè)化探討    周達(dá)彪;唐懋華;

一株耐酸堿嗜熱產(chǎn)甲烷菌的分離與系統(tǒng)發(fā)育分析    胡亞東;袁月祥;閆志英;廖銀章;劉曉風(fēng);賀蓉娜;張洪森;官家發(fā);朱聯(lián)碧;

雞糞沼氣池產(chǎn)甲烷菌多樣性    郎會(huì)花;楊洪江;張永剛;

若爾蓋高原產(chǎn)甲烷菌數(shù)量的時(shí)空差異性    湯博;唐杰;吳俐莎;楊志榮;張杰;

產(chǎn)氫產(chǎn)乙酸菌ZR-1的分離鑒定及產(chǎn)酸特性    習(xí)彥花;程輝彩;張麗萍;崔冠慧;馬金亮;

一株生長pH較寬的產(chǎn)甲烷菌分離與系統(tǒng)發(fā)育分析    胡亞東;袁月祥;閆志英;廖銀章;劉曉風(fēng);賀蓉娜;張洪森;官家發(fā);

一株近海沉積物中產(chǎn)甲烷菌的分離及鑒定    仇天雷;承磊;羅輝;張輝;吳曉磊;鄧宇;

中藥藥渣的綜合利用與處理    吳純潔,王一濤,雷佩琳

厭氧真菌體外發(fā)酵篩選技術(shù)的研究    朱偉云,毛勝勇,王全軍,姚文,M K Theodorou

PCR-DGGE技術(shù)在農(nóng)村戶用沼氣發(fā)酵微生物研究中的初步應(yīng)用    師曉爽;劉德立;郎志宏;黃大昉;陸偉;李敏;

內(nèi)蒙古白絨山羊不同放牧期瘤胃甲烷菌mcrA基因的RFLP分析    郭雪峰;李華偉;李長青;金海;盧德勛;永西修;栗原光規(guī);

古菌──原核生物到真核生物的過渡?    東秀珠

土壤微生物總DNA的提取和純化    張瑞福,曹慧,崔中利,李順鵬,樊奔

變性梯度凝膠電泳法研究斷奶仔豬糞樣細(xì)菌區(qū)系變化    朱偉云,姚文,毛勝勇

海綿Pachychalina sp.體內(nèi)古菌多樣性非培養(yǎng)技術(shù)分析    方再光,黃惠琴,張開山,潘志強(qiáng),鮑時(shí)翔

中國農(nóng)村戶用沼氣主要發(fā)酵原料資源量的估算    李軼冰;楊改河;楚莉莉;陳豫;

產(chǎn)甲烷常溫菌和嗜熱菌代謝網(wǎng)絡(luò)特征的比較研究    陳璟;丁彥蕊;須文波;

自然濕地土壤產(chǎn)甲烷菌和甲烷氧化菌多樣性的分子檢測    佘晨興;仝川;

水牛TLR4 cDNA全長的克隆及其生物信息學(xué)分析    匡文華;張曉茹;成鷹;杜麗;張冬琳;郝永昌;雷明;焦寒偉;劉濤;祁超;王鳳陽;

產(chǎn)甲烷常溫古細(xì)菌和嗜熱古細(xì)菌代謝網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)與功能間的關(guān)聯(lián)性研究    陳璟;丁彥蕊;須文波;

油脂廢水生物處理研究進(jìn)展    劉國防;梁志偉;楊尚源;杜平;楊悅;陳英旭;

仔豬結(jié)腸中產(chǎn)甲烷菌群多樣性及其與環(huán)境因子的相關(guān)性    毛勝勇;蘇勇;楊翠鳳;朱偉云;

厭氧產(chǎn)甲烷受抑制過程的三維熒光光譜解析    李衛(wèi)華;盛國平;陸銳;趙全保;俞漢青;

凍土甲烷循環(huán)微生物群落及其對全球變化的響應(yīng)    倪永清;史學(xué)偉;鄭曉吉;顧燕玲;徐宇麗;程國棟;

四環(huán)素類制藥廢水厭氧生化預(yù)處理研究    唐禮慶;何成達(dá);王惠民;周保昌;

微生物白云巖模式研究進(jìn)展    由雪蓮;孫樞;朱井泉;劉玲;何凱;

低溫產(chǎn)甲烷菌的研究現(xiàn)狀    宋素琴;張志東;顧美英;房世杰;

江西地方品種水牛產(chǎn)肉性能及肉品質(zhì)分析研究    吳志勇;王榮民;楊艷;徐桂花;余華陽;

PCR-DGGE技術(shù)在水牛瘤胃產(chǎn)甲烷古菌多樣性探索中的應(yīng)用    劉園園;王士長;

德宏水牛保種與育種問題探討    湯守錕;

不同生長階段水牛絕食代謝的研究    楊炳壯;文秋燕;梁賢威;鄒彩霞;覃廣勝;廖朝輝;龐春英;梁坤;陳明堂;潘玉紅;熊小榮;

青年摩雜一代水牛下丘腦催產(chǎn)素的免疫組化定位    宋小白;韓濤;韓忠燕;秦津;李瑞明;謝瑩雪;

水牛超數(shù)排卵技術(shù)研究    趙智勇;楊紅遠(yuǎn);湯守琨;趙家明;邵慶勇;朱士恩;洪瓊花;

水牛DGAT1基因克隆及SNP分析    周軍;劉兆良;胡曉湘;李寧;

水牛同期發(fā)情、超數(shù)排卵和胚胎移植初探    和占星;羅在仁;和協(xié)超;朱芳賢;鈴木達(dá)行;尹安強(qiáng);創(chuàng)向輝;黃曉松;

肇源出土的王氏水牛    魏正一;

廣西水牛研究真“牛”    記者 田艷

世界首例轉(zhuǎn)基因水牛在廣西誕生    江東洲　高欲垚

世界首例轉(zhuǎn)基因克隆水牛在廣西誕生    記者 劉琴　通訊員 劉慶友 高欲垚

轉(zhuǎn)基因,讓廣西水牛更牛!    本報(bào)記者 周元元

水牛改一改 增收一千塊    本報(bào)記者 冼敏

水牛的放牧飼養(yǎng)    科科

放養(yǎng)水牛應(yīng)注意血吸蟲感染    周燕芬

《水牛哪兒去了》是篇好新聞    張中偉

成年水牛不發(fā)情的及早治療    張仕權(quán) 張李強(qiáng)

中國地方水牛的遺傳多樣性    張桂香

瘤胃產(chǎn)甲烷菌定量檢測與微生物菌群調(diào)控研究    郭嫣秋

水和乳化液對煤層產(chǎn)甲烷菌群活性影響研究    肖棟

厭氧烴降解產(chǎn)甲烷菌系的組成及其代謝產(chǎn)物的特征    周蕾

水牛性別控制相關(guān)問題的研究    陸陽清

轉(zhuǎn)基因體細(xì)胞克隆水牛與廣西水牛的遺傳特性研究    崔奎青

水牛卵泡顆粒細(xì)胞凋亡和幾種抗氧化劑對體外卵泡顆粒細(xì)胞存活的影響    何寶祥

水牛卵母細(xì)胞體外成熟與凋亡的初步研究    王曉麗

水牛卵母細(xì)胞體外成熟及其調(diào)控的研究    卞桂華

水牛γ-干擾素單克隆抗體制備及水牛結(jié)核病夾心ELISA檢測方法的初步建立    徐賢坤

水牛卵母細(xì)胞孤雌激活與體細(xì)胞核移植的研究    楊素芳

提高產(chǎn)甲烷菌活性的應(yīng)用研究    呂映輝

mcrA基因的克隆及其在分析沼氣池產(chǎn)甲烷菌多樣性中的應(yīng)用研究    徐彥勝

水牛和黃牛同種內(nèi)及種間顯微受精的初步研究    牛向麗

黃牛和水牛種間嵌合的初步研究    卞桂華

水牛實(shí)驗(yàn)感染大片形吸蟲的研究    吳文德

地方水牛品種遺傳分化水平的研究    許明

水牛抑制素α亞基基因的克隆    謝體三

水牛卵母細(xì)胞體外受精及胚胎質(zhì)量評定的研究    謝英

水牛GV期卵母細(xì)胞程序化冷凍研究    肖開田

沼氣發(fā)酵過程中產(chǎn)甲烷菌分子多樣性研究及產(chǎn)甲烷菌的分離    汪婷