如何優(yōu)化Chem 3D分子構(gòu)型

熱心網(wǎng)友：1、MM2分子力學優(yōu)構(gòu)型優(yōu)化方法使用Chem 3D軟件MM2分子力學優(yōu)化構(gòu)型的操作步驟是繪制出化學結(jié)構(gòu)之后，依次選擇Calculations/MM2/Minimize Energy（最小化化學能）命令，如下圖所示：MM2分子力學優(yōu)構(gòu)型優(yōu)化方法接著會彈出Minimize Energy對話框，“Display Every nth Iter用于顯示每輪迭代信息”、“Copy Measurements to Output Bo用于控制輸出每輪結(jié)構(gòu)參數(shù)”、“Minimum RMS是構(gòu)型收斂標準”。另外注意一下，MM2分子力學方法計算量小，適合于大體系有機分子的構(gòu)型優(yōu)化。2、Gamess量子化學軟件包構(gòu)型優(yōu)化方法Gamess量子化學軟件包進行構(gòu)型優(yōu)化的原理是Chem 3D根據(jù)初始分子模型計算能量和梯度，然后決定寫一部結(jié)構(gòu)調(diào)整的方向的步長，根據(jù)各原子受力情況和位移大小判斷是否收斂，若沒有則繼續(xù)重復上面的過程直到力和位移的變化均達到收斂標準。在Chem 3D軟件中的操作方法是：繪制出分子結(jié)構(gòu)之后，依次點擊Calculations/GAMESS Interface/Minimize，隨后會彈出如下圖所示的GAMESS對話框。Gamess量子化學軟件包構(gòu)型優(yōu)化方法對話框Job&Thery選項卡的Method選項可以更改計算方法，Basis Set是基組類型，Wave Function是波函數(shù)類型，通過Polarization、Diffuse和Exponent可以添加或彌散基函數(shù)，Opt.Algorithm用于修改構(gòu)型優(yōu)化方法，最后的兩個選項Spin Multiplicity和Net Charge指的是體系電荷和自選多重度。在Advanced-1選項卡中，繪制者可以更改自洽場迭代參數(shù)控制、溶劑效應及其模型、MO初始猜測類型、點群及其主軸。GAMESS Interface所計算性質(zhì)包括：偶極矩、電子密度、靜電勢、動能、Lowdin電荷和布居數(shù)、Mulliken電荷和布居數(shù)、勢能和總能量。