西藏羊八井廢棄地?zé)釤峋募?xì)菌多樣性

【摘要】：【目的】旨在研究羊八井熱田兩廢棄地?zé)釤峋练e物及熱水中的細(xì)菌多樣性?！痉椒ā坎捎梅桥囵B(yǎng)分子分析技術(shù)分別構(gòu)建了熱井A沉積物A樣、水樣A以及熱井B沉積物B樣總DNA的16S rRNA基因文庫(kù),并對(duì)每個(gè)文庫(kù)中隨機(jī)挑選的克隆子進(jìn)行擴(kuò)增rDNA限制性酶切片段分析(amplified ribosomal DNA restriction analysis,ARDRA),分別選取文庫(kù)中不同分類單元的陽(yáng)性克隆子進(jìn)行測(cè)序,將所得到的數(shù)據(jù)與國(guó)際基因數(shù)據(jù)庫(kù)GenBank的序列進(jìn)行相似性比較并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。【結(jié)果】熱井A和熱井B的細(xì)菌類群大多為典型的棲熱細(xì)菌,均以變形菌(Proteobacteria)為優(yōu)勢(shì)類群(在熱井A沉積物A中為41.08%、在水樣A中為38.00%,以及在熱井B的沉積物B中為42.57%,下同),以恐球菌-棲熱菌(Deinococcus-Thermus)為亞優(yōu)勢(shì)類群(10.71%、20.00%、21.30%);此外兩熱井沉積物中均發(fā)現(xiàn)熱泉中比較少見(jiàn)的且為亞優(yōu)勢(shì)類群的酸桿菌(Acidobacteria)(在熱井A沉積物A中為16.07%、在熱井B的沉積物B中為19.15%),熱井A沉積物中第三個(gè)亞優(yōu)勢(shì)類群為壁厚菌門(mén)(Firmicutes)的真桿菌(Eubacterium sp.)(14.28%);水樣A中則沒(méi)有檢測(cè)到酸桿菌,而以產(chǎn)水菌門(mén)(Aquificae)的產(chǎn)氫桿菌屬(Hydrogenobacter)為另一亞優(yōu)勢(shì)類群(16.00%)。此外兩熱井中均檢測(cè)到綠彎菌(Chloroflexi)、藍(lán)藻(Cyanobacteria)以及噬纖維菌-屈撓桿菌-擬桿菌群(Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides,CFB group)等類群的細(xì)菌。【結(jié)論】通過(guò)與文獻(xiàn)比較分析,發(fā)現(xiàn)羊八井熱田中細(xì)菌類群大多為典型的棲熱細(xì)菌,如恐球菌-棲熱菌、產(chǎn)水菌、綠彎菌、藍(lán)藻以及candidate division OP類群的微生物等;但是尚有一些不常見(jiàn)的細(xì)菌類群如弧菌(Vibrio sp.)、Bacteriovorax sp.、未培養(yǎng)的酸桿菌和Holophaga(uncultured Holophaga/Acidobacterium)和未確定的疣微菌(Unidentified Verrucomicrobium)等,羊八井熱田地?zé)岬拈_(kāi)發(fā)變遷和地下冷熱水交融可能與細(xì)菌類群的復(fù)雜性有關(guān)。 【作者單位】： 西藏高原生物研究所;中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 有害生物控制與資源利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 熱井 沉積物 S rRNA基因文庫(kù) 系統(tǒng)發(fā)育分析
【分類號(hào)】：Q938
【正文快照】： 地?zé)釤崛虻責(zé)岢隹诔Ｒ?jiàn)的主要的嗜熱細(xì)菌有產(chǎn)水菌目(Aquificales)、熱袍菌目(Thermotogales)、棲熱菌目(Thermales)、熱脫硫桿菌目(Thermodesulfobacteriales)、綠彎菌目(Chloroflexales)、綠菌目(Chlorobiales)、藍(lán)藻綱(Cyanobacteria)、變形菌門(mén)(Proteobacteria)以及革蘭

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近200年來(lái)瀘沽湖沉積物藻類記錄對(duì)氣候變化的響應(yīng)    陳傳紅;汪敬忠;楊劭;

泥—水界面過(guò)程對(duì)渤海南部海域磷硅循環(huán)的影響    宋金明;李鵬程;羅延馨;

渤海南部海域沉積物中吸附態(tài)氮和總氮的分布特征及控制因素    馬紅波;宋金明;

蠶豆保衛(wèi)細(xì)胞中脫落酸誘導(dǎo)過(guò)氧化氫產(chǎn)生的亞細(xì)胞定位    苗琛;詹衛(wèi)華;周云;安國(guó)勇;董發(fā)才;宋純鵬;

遼河流域典型河段沉積物對(duì)PAHs生物降解特性研究    全向春;湯茜;王育來(lái);何孟常;林春野;郭偉;王浩正;

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要重建珊瑚礁家園    王秋蓉

海底動(dòng)物稀少之謎獲解    劉霞

沉積物提示古人類滅亡原因    田地編譯

第三次物種大滅絕徹底改變地球生態(tài)    本報(bào)記者 馬佳

“龍骨”證明同心曾是“樂(lè)園”    本報(bào)記者　蘇峰

英科學(xué)家稱發(fā)現(xiàn)生活了26億年的生物    曉舟

恐龍有挖洞習(xí)性？    

大山鋪恐龍糞便樣化石輾轉(zhuǎn)求證    記者 熊心權(quán) 冉昌龍

世界最大生物足跡化石群驚現(xiàn)內(nèi)蒙古    記者 李曉明

發(fā)現(xiàn)地球上最古老的生物    李寧

沉水植物與富營(yíng)養(yǎng)湖泊水體、沉積物營(yíng)養(yǎng)鹽的相互作用研究    謝貽發(fā)

應(yīng)用蠶豆根尖微核技術(shù)研究混合污染物及土壤、沉積物和垃圾焚燒灰的遺傳毒性    封少龍

膠州灣浮游植物與沉積物中硅藻群落結(jié)構(gòu)演替的研究    劉東艷

太湖大型水生植被及其環(huán)境效應(yīng)研究    雷澤湘

河口潮灘濕地沉積物中胞外酶研究    劉存歧

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低緯度西太平洋硅藻席沉積時(shí)空分布及群落組成研究    翟濱

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青島太平灣砂質(zhì)潮間帶小型底棲生物群落結(jié)構(gòu)與多樣性的研究    劉海濱

太平洋暖池區(qū)深海沉積物中微生物分子生態(tài)學(xué)研究    曾潤(rùn)穎

南極阿德雷島沉積物細(xì)菌多樣性及環(huán)境意義    張銳

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東海陸架及南海北部鋒區(qū)微生物群落結(jié)構(gòu)初探    潘洛安

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青島近海沉積物及貽貝中環(huán)境荷爾蒙的研究    潘靜