產(chǎn)甲烷常溫菌和嗜熱菌代謝網(wǎng)絡(luò)特征的比較研究

【摘要】：以產(chǎn)甲烷的常溫古細菌Methanosarcina acetivorans(MAC)和嗜熱古細菌Methanopyrus kandleri(MKA)的代謝網(wǎng)絡(luò)為研究對象,分析了網(wǎng)絡(luò)的拓撲結(jié)構(gòu)與功能之間的關(guān)聯(lián)性。本文利用Networkx計算了代謝網(wǎng)絡(luò)的度、度的中心性、緊密度中心性以及介數(shù)中心性等參數(shù)值,通過比較分析發(fā)現(xiàn)常溫古細菌MAC和嗜熱古細菌MKA存在氨基酸代謝以及碳水化合物代謝保守途徑,且都具有明顯更高的度。結(jié)果同時表明子途徑00010(糖酵解/糖異生)、00020(檸檬酸循環(huán))、00250(丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代謝)是常溫古細菌MAC與嗜熱古細菌MKA2個生物體的重要途徑。 【作者單位】： 江南大學物聯(lián)網(wǎng)工程學院;工業(yè)生物技術(shù)教育部重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 代謝網(wǎng)絡(luò) 古細菌 產(chǎn)甲烷菌
【基金】：國家自然科學基金資助項目(21001053) 中央高?；究蒲袠I(yè)務(wù)費專項資金資助(JUSRP11126)
【分類號】：Q811.4
【正文快照】： 1引言近年來，利用復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)理論來研究真實網(wǎng)絡(luò)，并通過圖論、計算機模擬等方法研究網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)特征、網(wǎng)絡(luò)的生成機制及演化規(guī)律等一系列問題，己取得了一些重要成果，其發(fā)展為在系統(tǒng)水平上研究生物網(wǎng)絡(luò)提供了新平臺l1J。對代謝網(wǎng)絡(luò)復(fù)雜的拓撲結(jié)構(gòu)的研究，己成為最近幾年的熱

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