吳仲義蒲慕明：當(dāng)病毒進化遠快于信息傳播，期刊要有所作為

基于2002-2003年非典的經(jīng)驗，武漢新型冠狀病毒最主要的威脅將會來自于它在人群中的不斷進化。大規(guī)模的基因組測序能夠識別傳染性毒株，因此序列數(shù)據(jù)應(yīng)該及時地收集和共享。專業(yè)性學(xué)術(shù)期刊（包括NSR）應(yīng)當(dāng)促進這類信息迅速傳播。 
新型冠狀病毒最初在中國武漢的肺炎患者中被發(fā)現(xiàn)，然后迅速成為公共衛(wèi)生焦點事件。更加棘手的是，新型冠狀病毒的大規(guī)模爆發(fā)正值流感發(fā)病高峰，而此前流感已經(jīng)引起了世界范圍內(nèi)數(shù)千人的死亡。于是在中國，原本很普通的流感病例，現(xiàn)在卻會引起人們的焦慮和恐慌，也增加了對醫(yī)療系統(tǒng)的壓力。
一些研究工作已經(jīng)在短期內(nèi)發(fā)表[1-7]。目前認為2019-nCov病毒可能起源于蝙蝠。一項研究[7]發(fā)現(xiàn)新型冠狀病毒與一種蝙蝠攜帶的冠狀病毒相似度高達96.2%。對其他冠狀病毒的研究顯示可能存在中間動物宿主，但中間宿主是什么尚不明確。分類學(xué)研究認為2019-nCov是SARS病毒的遠親[1,7,8]。
潛在威脅——病毒在人群中的迅速進化
公眾對病毒傳播的關(guān)注點多在“數(shù)量”方面 – 更多病毒攜帶者會帶來更多的潛在感染。但是，相比數(shù)量上的改變，更需要關(guān)注的是自然選擇驅(qū)動的質(zhì)變。傳染性毒株的增加首先會導(dǎo)致少量具有繁殖優(yōu)勢的毒株的產(chǎn)生。隨后這些帶有繁殖優(yōu)勢的克隆會在數(shù)量上占據(jù)主導(dǎo)，從而獲得更多進一步進化的機會。病毒從蝙蝠到達人群身上后，進化仍然不會停止。
在2002-2003年非典爆發(fā)期間，就有研究觀測到了這種發(fā)生在人群中的傳染性的進化，即逐步進化出現(xiàn)了具有超級傳染性的毒株。從病毒株的基因組數(shù)據(jù)中，我們可以收集到這種進化的證據(jù)。在SARS病毒中，最具侵略性的菌株在多個關(guān)鍵基因上存在突變，而這些突變需要時間來累積。通常認為在多數(shù)病人身上發(fā)現(xiàn)的占主導(dǎo)地位的單克隆是逐步形成的，它們最終可能進化成為超級病毒。同樣重要的是，那些在進化樹上累積了許多突變的樣本，但數(shù)量上較少的克隆，有可能蓄勢待發(fā)，在短期內(nèi)變成優(yōu)勢克隆。
1月中旬2019-nCoVs的威脅
目前已發(fā)表的針對2019-nCoVs的研究都集中在它與寄生于蝙蝠上的近緣物種之間的分化[1,4,7]。已經(jīng)發(fā)表的序列數(shù)據(jù)非常有限，無法解釋病毒在人群中的進化。但目前30多個公開基因組數(shù)據(jù)(http://virological.org/; https://www.gisaid.org)為我們了解新型病毒提供了一個渠道。正如相關(guān)研究所揭示[8]，2020年1月份上半月2019-nCoVs的進化是相對平和的?？梢运梢豢跉獾氖牵谶@一時期，不同的毒株是平行進化的，并沒有產(chǎn)生占據(jù)主導(dǎo)性的毒株。
但一份包含3個來自廣東和1個來自美國的樣本組值得關(guān)注，這四個樣本在一月中旬前已擴增，可能是更強病毒出現(xiàn)的征兆。那么我們不禁要問，從1月中旬至今這個時間段里，病毒出現(xiàn)了怎樣的進化。1月中旬以來的新病例可能預(yù)示了2019-nCoVs的進化方向，這也是未來的研究需要回答的問題。
病毒快速進化vs論文發(fā)表滯后 —— 問題的解決方案
毫無疑問，對2019-nCoVs病毒的測序工作應(yīng)該涵蓋所有地理區(qū)域和時間節(jié)點。測序能夠揭示最具有威脅性的毒株，對毒株的判斷將對治療方案的定奪和藥物的研發(fā)產(chǎn)生影響，相關(guān)的檢疫隔離措施也離不開這樣的信息。這些信息應(yīng)該在第一時間被研究人員和公眾掌握。
但不容樂觀的是，研究團隊往往在相關(guān)文獻正式發(fā)表后才能獲得這些信息。在互聯(lián)網(wǎng)上，關(guān)于非授權(quán)使用未發(fā)表序列信息的爭議熱火朝天。學(xué)術(shù)論文發(fā)表的速度遠不能滿足序列數(shù)據(jù)實時發(fā)布的科研需求。盡管科學(xué)論文的發(fā)表已經(jīng)快馬加鞭，但所刊登的序列主要還是1月中旬之前采集的，相關(guān)結(jié)論也已經(jīng)在媒體上廣泛流傳。
基于此，我們建議學(xué)術(shù)期刊著手刊登那些對樣本和序列有詳盡描述的測序數(shù)據(jù)。對這些數(shù)據(jù)的分析解釋可能還并不深入，但是通過對這些數(shù)據(jù)的分析往往能獲得重要的臨床信息。通過這樣的操作，我們能夠保證相關(guān)測序工作被規(guī)范的引用?；谶@些數(shù)據(jù)更加深入的研究分析和解釋終究會造福于民。NSR將開始接收這類投稿，并開通快速評審?fù)ǖ馈?br>后續(xù)需要跟進的工作
解除當(dāng)下危機之后，中國需要面對和處理野生動物貿(mào)易的根源問題。人員密集的社會更利于病毒的感染和傳播，因此通常傾向于與野生動物保持一定的隔離。而頻繁接觸野生動物的人居群落通常人口稀少。高密度人群與野生動物的接觸是危險的，即使這種接觸不能夠完全被消除，也需制定嚴格的規(guī)章制度加以控制。此次疫情爆發(fā)與擴散距離非典爆發(fā)不到20年，我們需要從中吸取經(jīng)驗教訓(xùn)。
本文來自吳仲義與蒲慕明。 吳仲義為《國家科學(xué)評論》(National Science Review，NSR)生命科學(xué)評審組長；蒲慕明 為《國家科學(xué)評論》(National Science Review，NSR)執(zhí)行主編。
（原標題 當(dāng)“病毒進化”遠快于“信息傳播”時，學(xué)術(shù)期刊要有所作為）